มัสยิดดาโต๊ะเป็นมัสยิดเก่าแก่ มีเอกลักษณ์ทางสถาปัตยกรรมคล้ายกับมัสยิดกรือเซะจึงได้ขึ้นทะเบียนเป็นโบราณสถานเมื่อ พ.ศ. 2478 มีรูปแบบและโครงสร้างของมัสยิดคล้ายกับรูปแบบของมัสยิดกรือแซะ
ตามหลักความเป็นจริงในการสร้างมัสยิดนั้นจะสร้างหลังการก่อตั้งชุมชน แต่ที่หมู่บ้านดาโต๊ะเป็นเมืองท่าเรือ (สะบารัง) มาก่อนมีพ่อค้าหลากหลายเชื้อชาติมาค้าขายที่นี่ แต่พ่อค้าส่วนใหญ่เป็นพ่อค้าชาวมุสลิม เจ้าเมืองจึงเกิดความคิดที่จะสร้างมัสยิดเพื่อให้ผู้มาค้าขายได้ประกอบศาสนกิจ ซึ่งมัสยิดดาโต๊ะนี้มีรูปแบบและโครงสร้างของมัสยิดคล้ายกับรูปแบบของมัสยิดกรือแซะ ซึ่งมัสยิดกรือแซะกับมัสยิดดาโต๊ะจะสร้างขึ้นในช่วงปลายสมัยกรุงศรีอยุธยาและช่วงต้นรัตนโกสินทร์ประมาณอายุกว่า 200 ปี หลังจากมีมัสยิดก็เริ่มมีคนมาอพยพจากปางปู ยะหริ่งมาตั้งถิ่นฐาน เพื่อความสะดวกในการทำการประมง ต่อมากรมศิลปากรได้มาสำรวจโบราณและพบว่ามัสยิดดาโต๊ะเป็นมัสยิดเก่าแก่ มีเอกลักษณ์ทางสถาปัตยกรรมคล้ายกับมัสยิดกรือเซะจึงได้ขึ้นทะเบียนเป็นโบราณสถานเมื่อ พ.ศ. 2478 ต่อมาประชากรเริ่มมากขึ้นจึงต้องสร้างมัสยิดหลังใหม่เพื่อให้เพียงพอกับจำนวนสมาชิกในหมู่บ้านดาโต๊ะ
